这款仙剑时空传既非前传，也非后传,游戏讲述的是一个仙剑奇侠传的超级fans陈寒轩因机缘巧合进入仙剑游戏中，他不甘心灵儿悲惨命运的发生，为改变灵儿宿命而与游戏管理员作斗争的故事,其主线以仙剑游戏中一些经典剧情的经历来展现。
根据游戏隐藏任务的完成情况,有宿命未能改变的普通结局与改变灵儿宿命的隐藏结局两个结局。还有结局由你来控制。
所谓的隐藏任务线实际上就是要完成几个十里坡任务，在隐龙窟中捡到十里坡通行证后，随时可以使用该物品进入十里坡，当从蛤蟆洞系统提示你，开放十里坡任务之后，就可以到十里坡中找七夕小雨领任务了。
蛤蟆洞任务：找绣花鞋打某怪物后得到 　　
蜀山任务：打几张CD和海报分别可以在蜀山大厅、铁锁桥、锁塔妖中可以找到 　　
水底任务：寻找月光这个就只有你自己好好找一下了，在下方的某亮光处，有隐藏场景。完成每个任务后，请及时到十里坡中找七夕小雨交差，获得奖励，最后一次的奖励，就是专门打拜月合体魔兽用的 　　
隐藏结局：找到并干掉拜月（必须将其干掉）后发现拜月仍然没死，灵儿准备完成宿命，印封拜月，但被陈寒轩给拦住了，他夺过天蛇杖，将灵儿推离现场，让灵儿在外面等“他”结果他自己与拜月同归于尽了。 
之后就看到了新仙剑中的灵儿隐藏结局。再就是七夕小雨等几个作者的一番感慨。